6月2日6时，中央气象台发布暴雨蓝色预警和强对流天气蓝色预警，覆盖福建、广东、广西等十余省份。中国气象局国家空间天气监测预警中心指出，6月1日至3日可能连续发生地磁暴，6月2日左右，我国北部有机会出现较为明显的极光，部分地区甚至有出现红绿复合极光的可能。

预计6月2日14时至3日14时，东北地区中西部、江南东部、华南中部等地的部分地区将有8级以上雷暴大风或冰雹天气，其中内蒙古东南部、吉林西部、辽宁中西部等地的部分地区将有10级以上雷暴大风，最大风力可达11级以上，辽宁中部偏西、吉林西部的局地不排除出现龙卷的可能性。东北地区中南部、江南东部、华南中部、西南地区南部等地的部分地区将有小时雨量大于20毫米的短时强降水天气，其中福建东南部、广西东南部、广东中西部等地的部分地区小时雨量大于50毫米。强对流的主要影响时段为当天午后至夜间。

6月2日14时至3日14时，福建东部和南部沿海、广东中南部、广西南部、云南西北部和东部、西藏东南部以及黑龙江西部、内蒙古东北部等地部分地区有大到暴雨，其中广东南部、云南西北部等地局地有大暴雨（100～150毫米）。上述部分地区伴有短时强降水（最大小时降雨量20～40毫米，局地可超过50毫米），局地有雷暴大风或冰雹等强对流天气。