电子显微镜设备在实验室中进行分析，能够对样品分析物，进行物性元素等方面的分析，哪怕是电气分析也可以在样品获取数据的过程中，这些软件的加入让功能变得更加的强大。并且这种设备的选择很多针对性也不一样，不一样的显微镜设备在进行研究分析的时候，选用方式还不同。
Cryo-EM实际上也是一种电子显微镜，不过作为一种透射电镜，在低温的环境中能够让样品持续维持低温，并且在样品处理技术中，使用比较简单，能够收集更高质量的数据的同时，确保样品在低温的环境中能够维持更长的时间，这种维持更长的时间能够让研究人员获得更全面的数据。
电子显微镜设备在选择的时候有些是透射电子显微镜，尤其是台式扫描显微镜这些不一样的选择，在样品分析的是一定要做出实际判断只有选择更合适的显微镜，才可以在分析的时候获得更好的效果。不同的电子显微镜，有些智能化程度很高，操作更加智能，这些产品的使用所带来的优势，能够获得更好的作用。
在分析研究中，分析观察设备非常重要，Cryo-EM的使用也是为了能够针对性进行研究，像一些蛋白质一样的复合物采用的一种设备，这种传统的显微镜根本不具备冷冻的效果，毕竟蛋白质复杂性比较不同，为了能够更好地去检验这些蛋白质，采用冷冻的一种方式对样品可以进行冷冻的研究，能够获得更准确的数据，在传染病或者是疾病方面能够带来更好的突破，可以获得更好的数据。这种电子显微镜的使用也是为了能够确保样品在冷冻的环境中保持稳定性，给工作人员更多的时间便于研究分析。